Existen diferentes vías de acceso:
Por acceso terrestre, en el kilómetro 148 de la ruta Interamericana hay una señalización que indica el cruce para Santa Clara La Laguna y es esa ruta la que se toma para bajar a San Juan La Laguna, pasando por Santa Clara La Laguna y por San Pablo La Laguna.
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Y por acceso acuático se puede tomar la lancha en Panajachel con destino a San Juan La Laguna.